基因表達(dá)系列分析（SAGE）是通過快速和詳細(xì)分析成千上萬個(gè)EST（express sequenced tags）來尋找出表達(dá)豐富度不同的SAGE標(biāo)簽序列。再次訪法中，通過限制性酶切可以產(chǎn)生非常短的cDNA（10-14bp）標(biāo)簽，并通過PCR擴(kuò)增和連接，隨后對(duì)連接題進(jìn)行測序。SAGE大大簡化和加快了3’端表達(dá)序列標(biāo)簽的收集和測序。同DD一樣，SAGE是一個(gè)“開放”的系統(tǒng)，可以發(fā)現(xiàn)新的未知的序列。在進(jìn)行標(biāo)本的比較之前，SAGE在cDNA的產(chǎn)生和處理上需要較多個(gè)步驟。由于SAGE是一個(gè)依賴DNA測序的基因計(jì)量方法，它對(duì)基因表達(dá)的測定比DD更加量化。由于需要進(jìn)行大量的測序反應(yīng)，所以費(fèi)用因素使大多數(shù)研究機(jī)構(gòu)對(duì)其廣泛應(yīng)用的主要限制。